L'economia en la comarca del Baix Maestrat es fonamenta principalment en les activitats següents: a) turisme, tant per la importància de les seues poblacions costaneres com Peníscola, Benicarló i Vinaròs, com pels bells racons i muntanyes de la Tinerça de Benifassà; b) l'agricultura, basada fonamentalment en el cultiu de cítrics i iolivar; c) la pesca; d) i la indústria, centrada en la fusta i el moble.

Sant Rafael del Riu, basa la seua economia en l'agricultura, l'activitat avícola i porcina, la indústria i durant els mesos d'estiu en el turisme.

Fins a temps recents el principal cultiu era l'oliverar, però en els últims anys, les característiques del terreny i el clima han propiciat la proliferació de vivers i plantació de tarongers. Quant a l'activitat avícola i porcina s'exercix des de fa anys en el municipi, contribuint també a l'economia local, encara que cada vegada amb menor intensitat.

Pel que fa a la indústria s'ha produït un cert auge en els últims anys a causa de l'esforç realitzat per a desenrotllar l'àrea de tallers i magatzems industrials. Actualment, hi ha empreses que es dediquen a la fabricació de complements del moble; empreses dedicades a maquinària, ferramenta i complements per a la indústria del moble, fabricació de mobles de cuina i reciclatge de plàstic i empreses dedicades a l'elaboració de prefabricats de formigó.

A més, en poc de temps es preveu la creació d'un nou polígon industrial de gran capacitat, amb excel·lents comunicacions.

D'altra banda, i donada la seua situació fronterera amb la capital de la província de Tarragona, es troba a només 6 Km. De La Sénia, municipi conegut en tota Catalunya per la seua indústria del moble.

En el nucli urbà trobem diferents comerços, comerços tradicionals i familiars: una botiga de comestibles; una carnisseria, on elaboren els embotits més famosos de la comarca del Baix Maestrat; un forn; un supermercat; una pescateria, on es pot comprar peix tots els divendres; una perruqueria; una farmàcia, bars, una gasolinera... comerços lligats a activitats artesanes.

D'altra banda, durant els mesos d'estiu Sant Rafael també té una economia basada en el turisme, un turisme que busca disfrutar de la pau i la tranquil·litat que oferix este municipi als seus visitants.

Turisme, que a poc a poc es veurà durant tot l'any amb la creació d'un camp de golf de 18 clots.